2018年31期

基于轉錄組測序數據分析及高通量GO注釋理論的研究

作  者 劉粉香,楊文國,孫勤紅
第一作者 劉粉香
作者單位 南京工業職業技術學院,江蘇南京
卷  號 46
發表年份 2018
發表刊期 31
發表頁面 88-91,100
關  鍵  字 二代測序;轉錄組;從頭拼接;GO注釋,
摘  要 隨著二代測序技術的快速發展,轉錄組測序在越來越多的動植物中完成,人們獲得了大批量的轉錄組數據序列。如何從這些海量的序列數據中挖掘具有生物意義的信息已成為很多研究的關鍵所在,對未知基因的功能進行預測和注釋就是其中一個重要的問題。轉錄組序列的功能注釋是功能基因組學研究的一項重要內容,基因本體論(gene ontology,GO)注釋目前是一種最重要的功能注釋方式。介紹了利用生物信息學軟件進行轉錄組測序數據分析過程,包括數據質量控制和過濾、從頭拼接(De novo assembly)、同源比對以及大規模GO注釋,為從事轉錄組測序特別是非模式植物轉錄組測序研究者在數據分析方面提供參考。
附  件 基于轉錄組測序數據分析及高通量GO注釋理論的研究
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