作 者 | 李偉哲,賈陽陽,劉露,肖勤 |
第一作者 | 李偉哲 |
作者單位 | 河北農業大學生命科學學院,河北保定 |
卷 號 | 47 |
發表年份 | 2019 |
發表刊期 | 8 |
發表頁面 | 119-122 |
關 鍵 字 | 桃拉病毒;基因;蛋白質;生物信息學分析 |
摘 要 | [目的]對桃拉病毒(Taura syndrome virus,TSV)的完整基因組進行生物信息學分析。[方法]通過生物信息學方法對基因序列組成、開放閱讀框、蛋白質理化性質、二級結構預測分析、蛋白跨膜結構的存在與否、蛋白信號肽存在與否以及蛋白質三級結構進行了預測分析。[結果]登錄NCBI網站下載TSV(JX094350.1)10 128 bp的基因片段,經生物信息學分析,編碼氨基酸3 286個,理論等電點(pI)為 5.14,相對分子質量為366 443.00 Da,不穩定系數(Ⅱ)為37.76,屬于穩定蛋白質;完整基因序列中包含2個開放閱讀框(open reading frame,ORF);蛋白中存在跨膜結構;沒有蛋白信號肽。[結論]對TSV的生物信息學分析有助于在分子水平上了解桃拉病毒的基因結構以及預測其感染機制,可為預防和治療蝦類的桃拉綜合征提供有用的信息。 |
附 件 | 桃拉病毒基因組的生物信息學分析 |
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