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2013年1期
豬圓環病毒同義密碼子的使用模式及其影響因素
| 作 者 | 牟一嬌，吳潤，王永錄 |
| 第一作者 | 牟一嬌 |
| 作者單位 | 甘肅農業大學動物醫學院，甘肅蘭州 |
| 卷 號 | 41 |
| 發表年份 | 2013 |
| 發表刊期 | 1 |
| 發表頁面 | 149-151 |
| 關 鍵 字 | 豬圓環病毒；密碼子使用模式；突變壓力；自然選擇 |
| 摘 要 | ［目的］揭示豬圓環病毒（PCV）基因組的進化特點和遺傳多樣性。［方法］通過計算PCV基因組的相對同義密碼子使用頻率（RSCU）、有效密碼子數目（ENC）和核苷酸含量等指標，對PCV基因組的密碼子使用模式進行了綜合分析。［結果］PCV基因組具有較低的GC含量和低的密碼子偏好性，不同基因型的PCV在密碼子使用上具有顯著差異，并且PCV與圓環病毒科中的其他病毒的密碼子使用模式也存在差異。PCV與其宿主的密碼子使用模式存在一定程度的相似性。此外，地理因素、蛋白質總的平均疏水性和芳香性等可能與PCV的密碼子使用模式的形成有關。［結論］PCV基因組的密碼子使用模式的形成是突變壓力與自然選擇相互作用的結果。該研究對闡明PCV的密碼子使用規律以及分子進化過程提供了最新的信息。 |
| 附 件 |
豬圓環病毒同義密碼子的使用模式及其影響因素
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