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2019年19期
雙歧桿菌BB12菌株Sec分泌途徑及底物蛋白分析
| 作 者 | 岳旭升，暮雪，張百惠，吳天，張路路，朱德全 |
| 第一作者 | 岳旭升 |
| 作者單位 | 佳木斯大學理學院，黑龍江佳木斯 |
| 卷 號 | 47 |
| 發表年份 | 2019 |
| 發表刊期 | 19 |
| 發表頁面 | 175-177 |
| 關 鍵 字 | 雙歧桿菌BB12；基因組；分泌蛋白；功能分析 |
| 摘 要 | ［目的］采用生物信息學方法分析雙歧桿菌BB12菌株的Sec途徑分泌系統及預測底物蛋白。［方法］以雙歧桿菌BB12菌株基因組注釋的蛋白氨基酸序列為研究對象，在NCBI中以Fasta形式下載，采用一系列生物信息學軟件分析該基因組中Sec分泌途徑及底物蛋白行使的功能，同時采用COG功能數據庫對這些蛋白進行功能注釋和聚類分析。［結果］通過分析發現雙歧桿菌BB12菌株Sec分泌途徑相關的蛋白基因共有9個，其中5個是Sec分泌途徑構建蛋白基因，2個信號肽酶識別基因，1個脂蛋白信號肽識別基因和1個信號肽識別蛋白編碼基因。Sec底物蛋白分析發現該菌共含1 583個蛋白，經過Sec分泌途徑到細胞外的蛋白有57個，35個具有COG功能，占61%，其中被Spase I型信號肽酶識別的有37個，被Spase Ⅱ 型信號肽酶識別的有20個。［結論］COG功能注釋顯示一些蛋白沒有功能，有功能的蛋白主要與氨基酸運輸和代謝、碳水化合物的運輸和代謝、功能細胞壁/膜和無機離子運輸和代謝功能有關。 |
| 附 件 |
雙歧桿菌BB12菌株Sec分泌途徑及底物蛋白分析
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