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2020年19期
脊尾白蝦低鹽轉錄組信息挖掘
| 作 者 | 沈曄，王興強，曹梅，鄭年昊，陳百堯 |
| 第一作者 | 沈曄 |
| 作者單位 | 江蘇海洋大學海洋生命與水產學院，江蘇連云港 |
| 卷 號 | 48 |
| 發表年份 | 2020 |
| 發表刊期 | 19 |
| 發表頁面 | 89-96 |
| 關 鍵 字 | 脊尾白蝦；低鹽脅迫；轉錄組 |
| 摘 要 | 通過前期對自然海水組（鹽度31.0）和淡水組（鹽度0.2）脊尾白蝦（Exopalaemon carinicauda）轉錄組的測序及分析，篩選出低鹽脅迫下差異表達顯著的基因并進行實時定量驗證，同時進行KEGG通路富集分析，挖掘低鹽脅迫相關信號通路，以期闡明脊尾白蝦在低鹽環境下的生理調控機制。轉錄組數據分析發現，脊尾白蝦機體可能通過磺基轉移酶活性的變化來調控類固醇、激素水平。表皮蛋白AMP5樣的表達量的變化表明低鹽脅迫可能影響脊尾白蝦節間膜的形成。低鹽脅迫試驗實時定量結果顯示，基因在鰓、肝胰腺和肌肉中的表達情況各有不同，并隨時間的變化，基因的表達量也會有所波動。Hedgehog信號通路分析發現，低鹽度脅迫條件下脊尾白蝦C型凝集素和低密度脂蛋白受體相關蛋白表達上調，推測機體通過調控C型凝集素和低密度脂蛋白受體相關蛋白，促進低密度脂蛋白的代謝，水解得到的膽固醇與Smo結合，激活Hedgehog信號通路，以響應低鹽脅迫。該研究挖掘了差異表達基因相關信號通路，推測低鹽脅迫可能通過調控代謝相關酶的活性來促進脊尾白蝦的生長代謝，并且低鹽脅迫可能影響神經遞質的調控過程。 |
| 附 件 |
脊尾白蝦低鹽轉錄組信息挖掘
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