作 者 | 雒林通,馬芳,唐德富,包曉娟 |
第一作者 | 雒林通 |
作者單位 | 天水師范學院生物工程與技術學院,甘肅天水 |
卷 號 | 48 |
發表年份 | 2020 |
發表刊期 | 21 |
發表頁面 | 86-90,94 |
關 鍵 字 | 太平雞;益生菌;回腸;轉錄組測序;SNP |
摘 要 | 為挖掘益生菌調節下太平雞回腸SNP位點,將120只太平雞隨機分為對照組與益生菌組,采用高通量測序技術對太平雞回腸轉錄組的SNP位點進行分析。結果顯示:SNP類型中,轉換類型明顯高于顛換類型,對照組中轉換類型占22.55%~27.45%,顛換類型占11.43%~13.87%;益生菌組與對照組結果相似,轉換類型(22.53%~27.46%)明顯高于顛換類型(11.37%~13.94%)。SNP位置分析表明,對照組和益生菌組總SNP位點分別為4 684 072和4 647 171個,其中位于內含子和基因間區的SNP位點最多。另外,在SNP功能分析中,同義突變SNP占比最高,在對照組和益生菌組中分別占7.01%和7.10%;非同義突變SNP在對照組和益生菌組中占比分別為2.97%和2.98%。該研究結果可為今后太平雞的分子標記開發、遺傳連鎖圖譜構建以及輔助育種等提供基礎數據。 |
附 件 | 基于益生菌調節的太平雞回腸SNP位點分析 |
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