2020年23期

維氏氣單胞菌感染異育銀鯽基因表達譜分析

作  者 施秀,張婷婷,貢成良,曹廣力,薛仁宇,張星,胡小龍
第一作者 施秀
作者單位 蘇州大學基礎醫學與生物科學學院,江蘇蘇州
卷  號 48
發表年份 2020
發表刊期 23
發表頁面 131-137,157
關  鍵  字 維氏氣單胞菌;異育銀鯽;表達譜
摘  要 [目的] 探討異育銀鯽在維氏氣單胞菌感染的條件下腎臟組織基因表達譜。[方法]運用RNAsequencing技術分析健康和感染維氏氣單胞菌的異育銀鯽腎臟組織中mRNA表達水平的變化。[結果] 通過比較維氏氣單胞菌感染組與健康對照組異育銀鯽腎臟組織基因表達的差異,發現維氏氣單胞菌感染后11567個基因表達水平發生了顯著變化,其中5 634個基因表達水平發生上調,5 933個基因表達水平發生下調。對所有差異表達基因(DEGs)進行功能注釋(GO)分析,發現1 325個DEGs含有GO注釋,其中上調和下調表達基因分別為581和744個;GO注釋結果顯示,上調表達基因主要富集于RNA指導的DNA聚合酶活性、Ⅱ型特異性脫氧核糖核酸酶活性、內切酶活性等;下調表達基因主要富集于吡哆醛結合、肽酶抑制劑活性和RNA指導的DNA聚合酶活性等。對所有DEGs進行KEGG通路分析,發現545個DEGs(215個上調表達基因,330個下調表達基因)含有KEGG注釋;上調表達基因主要富集于內質網中的蛋白質加工、抗原加工和呈現和雌激素信號通路等KEGG通路;下調表達基因富集通路主要富集于細胞因子-細胞因子受體相互作用、細胞黏附分子和jakSTAT信號通路等KEGG通路。對差異表達基因進行熒光定量PCR驗證,發現其與RNAsequencing結果具有相似的表達趨勢。[結論] 這些研究結果可為后續解析異育銀鯽對A.veronii感染的發病機制提供參考數據。
附  件 維氏氣單胞菌感染異育銀鯽基因表達譜分析
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