2021年06期

基于高通量測序研究龜鱉養殖水體細菌多樣性

作  者 高娜,梁陽陽,李靜,楊坤,方婷,趙秀俠,崔凱,盧文軒
第一作者 高娜
作者單位 安徽省農業科學院水產研究所,水產增養殖安徽省重點實驗室,安徽合肥
卷  號 49
發表年份 2021
發表刊期 6
發表頁面 99-102
關  鍵  字 龜鱉養殖;高通量測序;細菌多樣性;傳統微生物分離
摘  要 為研究龜鱉養殖水體中微生物資源特征并獲取其菌種資源,采用Illumina-MiSeq高通量測序技術對外塘和溫室養殖水體及生化流程處理后的尾水進行細菌多樣性分析。結果顯示,3組樣品在門水平上優勢菌為變形菌門和擬桿菌門,平均占比分別為55.89% 和14.37%。在屬水平上,細菌主要為不動桿菌屬,尚未分類的小梨形菌科和紅桿菌科。3組水樣中均有大量序列不能被歸入已知的屬,推測其中可能有尚未發現的潛在新種。溫室和外塘2種不同養殖模式下,水體理化因子及細菌群落結構組成均存在很大差異。傳統微生物分離方法篩選了52株細菌,歸屬于14種不同的細菌屬,其中大部分可作為水產益生菌使用。該研究結果為龜鱉養殖水體的微生態人工調控提供了理論依據。
附  件 基于高通量測序研究龜鱉養殖水體細菌多樣性
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