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2021年13期
基于轉錄組的金花茶PEBP基因家族的鑒定及分析
| 作 者 | 劉合霞，刁慧玲，舒楊，譚肖玲，韋曉曉，李妍，龍開蕓，蘇雅萍，趙嬌妹，李博 |
| 第一作者 | 劉合霞 |
| 作者單位 | 玉林師范學院生物與制藥學院，廣西玉林 |
| 卷 號 | 49 |
| 發表年份 | 2021 |
| 發表刊期 | 13 |
| 發表頁面 | 103-107 |
| 關 鍵 字 | PEBP基因家族；金花茶；保守基序；進化分析；表達量分析 |
| 摘 要 | 磷脂酰乙醇胺結合蛋白 (phosphatidyl ethanolamine binding protein, PEBP)在花的形態建成中具有重要作用，為了解該基因家族在金花茶開花過程中的調控作用，通過對金花茶的花瓣轉錄組測序數據進行生物信息學分析，從轉錄組數據庫中篩選金花茶(Camellia nitidissima)PEBP基因，并對其蛋白質性質、功能結構域、進化關系及開花過程中的表達模式進行了分析。結果表明，金花茶花瓣轉錄組中共含有9個PEBP基因家族成員，可以分為FT-like、TFL1-like、MFT-like、PEBP-like 4個亞基因家族；該蛋白家族主要由酸性、親水的穩定蛋白構成，定位于細胞核中；該基因家族Motif具有一定的保守型，且所包含的保守基序數目及種類存在一定差異。在金花茶開花過程中，CnPEBP 4基因的表達量不斷增高，該基因可能對金花茶花瓣形態建成具有一定的調控作用；而其他基因家族成員在金花茶花瓣組織中表達量較低或不表達。鑒定獲得了金花茶PEBP基因家族成員的序列和部分功能信息，為研究金花茶開花調控提供了理論參考，為金花茶開花調控機理的研究奠定基礎。 |
| 附 件 |
基于轉錄組的金花茶PEBP基因家族的鑒定及分析
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