摘 要 |
[目的]分析健康與患根腐病草莓根際土壤、非根際土壤及根內古菌群落結構與多樣性。[方法]運用Illumina MiSeq高通量測序技術,分別對根際土壤、非根際土壤及根內古菌16S rRNA基因的V3~V4區進行擴增并測序,分析健康與患根腐病草莓不同部位古細菌群落結構與多樣性。[結果]健康組共鑒定出11個門、19個綱、25個目、29個科、43個屬,患根腐病組共鑒定出11個門、20個綱、27個目、32個科、47個屬。門水平上,所有土壤樣品的優勢古菌門均為奇古菌門(Thaumarchaeota)、廣古菌門(Euryarchaeota)和烏斯古菌門(Woesearchaeota),所有根內樣品優勢菌門均為奇古菌門和廣古菌門;患根腐病草莓根際和非根際土壤的奇古菌門相對豐度均低于健康草莓,廣古菌門和烏斯古菌門相對豐度均高于健康草莓,患根腐病草莓根內樣品的奇古菌門和廣古菌門相對豐度均低于健康草莓。屬水平上,所有土壤樣品的優勢屬均為亞硝化球菌屬(Nitrososphaera)、亞硝化侏儒菌屬(Nitrosopumilus)和Methanomassiliicoccus屬,患根腐病草莓根際土壤亞硝化球菌屬相對豐度比健康減少9.27百分點,非根際土壤亞硝化球菌屬相對豐度比健康減少9.87百分點;所有根內樣品的優勢屬均為亞硝化球菌屬和甲烷孢菌屬(Methanocella),亞硝化球菌屬相對豐度比健康增加15.13百分點。[結論]健康與患根腐病草莓根際土壤、非根際土壤及根內樣品古菌群落組成差異明顯,說明草莓根腐病的發生與根際土壤、非根際土壤以及根內古菌群落結構改變密切相關。 |