2022年13期

云南原始地方種四路糯基因組中的MITE類轉座子“124”

作  者 武曉陽,楊亞洲,隆文杰,陳丹,周國雁,杜娟,伍少云,蔡青,黃興奇
第一作者 武曉陽
作者單位 云南大學生命科學學院,云南昆明
卷  號 50
發表年份 2022
發表刊期 13
發表頁面 93-97
關  鍵  字 糯玉米地方品種;四路糯;重測序;“124”轉座子;起源演化
摘  要 [目的]研究四路糯與普通玉米之間的親緣關系。[方法]比較四路糯與B73基因組中“124”轉座子的構成差異。[結果]在B73基因組中鑒定出13個“124”轉座子序列和其插入位點信息;通過重測序得到約120 Gb的四路糯基因組序列,并從中鑒定出17個“124”轉座子序列和其插入位點信息;在二者基因組中存在3個共同的“124”插入位點,這些位點展示出“124”轉座子在序列和插入位點一致;B73基因組和四路糯基因組中均存在與waxy基因中“124”一致的轉座子序列;建立的系統進化樹可將“124”轉座子歸為4種類型,其中并沒有單一基因組來源的類型。[結論]四路糯與B73基因組的差異是玉米種內的差異。
附  件 云南原始地方種四路糯基因組中的MITE類轉座子“124”
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