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2023年02期
日本沼蝦體重和出肉率聯合GWAS分析
| 作 者 | 劉帥，蔣麗 |
| 第一作者 | 劉帥 |
| 作者單位 | 上海海洋大學水產科學國家級實驗教學示范中心，上海 |
| 卷 號 | 51 |
| 發表年份 | 2023 |
| 發表刊期 | 2 |
| 發表頁面 | 108-110, 114 |
| 關 鍵 字 | 日本沼蝦；全基因組關聯分析；體重；出肉率 |
| 摘 要 | ［目的］定位篩選影響日本沼蝦體重及出肉率性狀的候選基因。［方法］收集成熟期且表現健康的日本沼蝦，記錄體重、出肉率，提取DNA進行測序并進行基因分型，獲得單核苷酸多態性(Single-nucleotide polymorphisms,SNP)標記數據，利用多性狀聯合的全基因關聯分析（Genome-wide association study,GWAS）方法檢驗與體重、出肉率性狀存在顯著相關的SNP位點，根據SNP的物理信息實現候選功能基因的篩選和定位。［結果］聯合分析共定位到6個SNP位點，檢測效率遠高于單一分析的1個SNP，根據6個顯著位點共定位到5個候選功能基因， 除1個功能未知的新基因外，剩余4個基因都與機體代謝、發育相關。［結論］完成了日本沼蝦體重、出肉率性狀相關基因的定位，可為日本沼蝦生長代謝的基因組水平揭示提供理論基礎，也可為日本沼蝦的其他數量性狀研究提供思路。 |
| 附 件 |
日本沼蝦體重和出肉率聯合GWAS分析
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