水曲柳節律相關GIGANTEA基因的克隆及同源性比對分析

作  者 蘇秋鈺,方傳雷,曹羊,李明莉,曾凡鎖
第一作者 蘇秋鈺
作者單位 東北林業大學生命科學學院,黑龍江哈爾濱
卷  號 42
發表年份 2014
發表刊期 8
發表頁面 2297-2300
關  鍵  字 水曲柳(Fraxinus mandshurica);GIGANTEA;生物節律;光周期;同源性分析;系統進化樹
摘  要

 [目的]對水曲柳節律相關GIGANTEA基因的克隆及同源性進行比對分析。[方法]根據GenBank中GI基因保守結構域設計簡并引物,進行PCR分析,并與其他物種的氨基酸序列進行同源性比對分析。[結果]獲得了編碼區780 bp的部分序列,可以編碼260個氨基酸,獲得的GI基因命名為FmGI,與多個物種GI基因有著較高的同源性,其中與葡萄、大豆、苜蓿、毛果楊、蓖麻、黃瓜、菊花、大麥、玉米、小麥、擬南芥、黑麥草、洋蔥和云杉等多個物種具有較高一致性。系統發育樹分析結果表明,GI基因按照單子葉植物、雙子葉植物和裸子植物的進化關系聚為3類,明確了水曲柳GI基因的系統進化關系。[結論]該方法對水曲柳生物節律鐘GI基因編碼區進行了克隆,并對獲得的部分GI蛋白序列進行了同源性比對分析,建立了系統進化樹,為進一步獲得水曲柳GI基因全長及研究其功能起到一定參考作用。

附  件 水曲柳節律相關GIGANTEA基因的克隆及同源性比對分析
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