蓖麻WRKY39基因的鑒別與表達特性分析

作  者 鄒智
第一作者 鄒智
作者單位 中國熱帶農業科學院橡膠研究所/農業部橡膠樹生物學與遺傳資源利用重點實驗室,海南儋州
卷  號 41
發表年份 2013
發表刊期 34
發表頁面 13311-13315
關  鍵  字 蓖麻;WRKY轉錄因子;電子克隆;生物信息學分析
摘  要

 研究基于已公布的EST數據,采用電子克隆的方法獲得了蓖麻WRKY39的基因序列。序列分析表明,該基因包含2個內含子,在釋放的基因組中因一堿基G的缺失而被錯誤注釋成2個基因;基因預測編碼356個氨基酸,理論分子量為38.95 kD,等電點為9.43;蛋白含有一個保守的WRKY結構域,其基序為WRKYGQK_X13_C_X5_C_X23_H_X1_H,歸屬于II類d亞類,其保守內含子位于304位的R和305位的G之間;基因的啟動子區含有多種激素和脅迫應答相關元件,顯示出復雜的轉錄調控網絡及在脅迫應答中的重要功能。基因表達譜分析顯示,RcWRKY39在葉片、花、胚乳和種子中都有表達,其中在種子中的表達豐度最高,在葉片和花中次之,在胚乳中最低。

附  件 蓖麻WRKY39基因的鑒別與表達特性分析
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