2016年27期

泰山螭霖魚線粒體COⅠ基因序列的遺傳多樣性分析

作  者 楊玲,鞏俊霞,付佩勝,李嫻,張金路
第一作者 楊玲
作者單位 山東省淡水水產遺傳育種重點實驗室,農業部黃河下游漁業資源環境科學觀測實驗站,山東省淡水漁業研究院,山東濟南
卷  號 44
發表年份 2016
發表刊期 27
發表頁面 127-130
關  鍵  字 泰山螭霖魚;COⅠ;遺傳多樣性,
摘  要 [目的]通過克隆泰山螭霖魚的COⅠ基因序列,研究其與鯉科幾屬魚類的進化關系,確定泰山螭霖魚的分類地位。[方法]以泰山螭霖魚30個個體為材料,對其線粒體細胞色素氧化酶亞基Ⅰ(COⅠ)的部分序列進行PCR擴增和序列對比,檢測泰山螭霖魚的遺傳多樣性;計算泰山螭霖魚不同單倍型與GenBank中鯉科5個屬魚類的遺傳距離,采用聚類分析方法,構建NJ和UPGMA系統進化樹。[結果]30個個體泰山螭霖魚線粒體COⅠ基因片段長度約1 600 bp,無堿基的插入和缺失,純化并去除引物序列后獲得約1 493 bp的核苷酸序列,存在6種單倍型,共檢測到6個多態位點,包括4個轉化、2個顛換,其單倍型多樣性(Hd)為0.460,核苷酸多樣性(Pi)為0.000 78,平均核苷酸差異數(K)1.163。遺傳距離和NJ和UPGMA系統進化樹表明,泰山螭霖魚與多鱗白甲魚的COⅠ序列一致,泰山螭霖魚所在的突吻魚屬與光唇魚屬的親緣關系最近,與金線鲃屬、倒刺鲃屬、華鯪屬的親緣關系較遠。[結論]該研究為其種質資源的管理與保護及遺傳育種提供分子生物學依據。
附  件 泰山螭霖魚線粒體COⅠ基因序列的遺傳多樣性分析
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