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2017年08期
動物雙歧桿菌AD011細胞壁蛋白的預測和功能分析
| 作 者 | 朱德全，王茗悅,姚嘉,張躍華,韓誠武,盧偉,欒積毅,劉向東 |
| 第一作者 | 朱德全 |
| 作者單位 | 佳木斯大學理學院，黑龍江佳木斯 |
| 卷 號 | 45 |
| 發表年份 | 2017 |
| 發表刊期 | 9 |
| 發表頁面 | 159-160 |
| 關 鍵 字 | 兩歧雙歧桿菌；基因組；細胞壁蛋白；功能, |
| 摘 要 | ［目的］運用生物信息學方法預測動物雙歧桿菌AD011錨定于細胞壁的蛋白并進行功能分析，為后續研究該菌與宿主相互作用的分子機制提供基礎資料。［方法］用Phobius和SignalP 4.0軟件對動物雙歧桿菌AD011全基因組編碼蛋白中細胞壁蛋白進行預測，同時采用COG (Cluster of Orthologous Groups of proteins)功能數據庫對預測的細胞壁蛋白進行功能注釋和聚類分析。［結果］動物雙歧桿菌AD011基因組1 518個編碼蛋白中，11個蛋白含有細胞壁的錨定基序，6個蛋白含有LP×TG基序，1個蛋白含有LysM基序，1個蛋白含有PG結合區域，2個蛋白含有SLH結構域，1個蛋白含有NLPC_P60結構域。細胞壁蛋白功能分析結果顯示，11個細胞壁蛋白中，9個蛋白沒有功能注釋，2個蛋白（NLP/P60 protein和1,4-beta-N-acetylmuramidase）參與細胞壁和細胞膜的生物合成。［結論］動物雙歧桿菌AD011大多數細胞壁蛋白功能未知，還需在以后的研究中進行進一步的功能注釋。 |
| 附 件 |
動物雙歧桿菌AD011細胞壁蛋白的預測和功能分析
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