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2017年19期
變異鏈球菌UA159細胞壁蛋白的預測和功能分析
| 作 者 | 朱德全,郝瑩瑩,姚嘉,張躍華,韓誠武,盧偉,欒積毅,劉向東 |
| 第一作者 | 朱德全 |
| 作者單位 | 佳木斯大學理學院，黑龍江佳木斯 |
| 卷 號 | 45 |
| 發表年份 | 2017 |
| 發表刊期 | 19 |
| 發表頁面 | 121-122 |
| 關 鍵 字 | 變異鏈球菌；基因組；細胞壁蛋白；功能, |
| 摘 要 | ［目的］ 對變異鏈球菌UA159細胞壁蛋白進行預測和功能分析，為后續研究該菌致病機制奠定基礎。［方法］ 用Phobius和SignalP 40軟件預測變異鏈球菌UA159的細胞壁蛋白，并采用COG功能數據庫對細胞壁蛋白進行功能注釋。［結果］ 變異鏈球菌UA159共含有 22個細胞壁蛋白，其中含有LPxTG錨定基序的有12個，含有LysM基序的有3個，含有CW基序的有5個，含有GW基序的有1個，含有PG錨定基序的有1個。功能分析結果顯示，22個細胞壁蛋白中有18個蛋白沒有具體的功能注釋，4個蛋白有具體的功能注釋，其中 beta-lactamase與防御機制功能有關；exo-beta-D-fructosidase與碳水化合物代謝與轉運有關；分子伴侶蛋白ATP-dependent protease ClpE與蛋白質翻譯后修飾和蛋白質折疊有關；cell wallassociated protein WapA與細胞壁和細胞膜的生物合成有關。［結論］ 變異鏈球菌UA159全基因組大多數的細胞壁蛋白功能未知，需在以后研究中進行進一步的功能注釋。 |
| 附 件 |
變異鏈球菌UA159細胞壁蛋白的預測和功能分析
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