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2017年29期
亞硝化單胞菌is79a3Sec途徑分泌系統及底物蛋白分析
| 作 者 | 朱德全，王純巖，溫馨，張武，張躍華 |
| 第一作者 | 朱德全 |
| 作者單位 | 佳木斯大學理學院，黑龍江佳木斯 |
| 卷 號 | 45 |
| 發表年份 | 2017 |
| 發表刊期 | 29 |
| 發表頁面 | 153-154，206 |
| 關 鍵 字 | 亞硝化單胞菌；分泌蛋白；分泌途徑；功能分析, |
| 摘 要 | ［目的］分析亞硝化單胞菌is79a3 Sec途徑分泌裝置及底物蛋白。［方法］從NCBI中選取亞硝化單胞菌 is79a3菌株基因組注釋的蛋白質氨基酸序列，采用Blast程序搜尋基因組中編碼Sec途徑分泌裝置的蛋白，同時采用SignalP 4.0、LipoP、TMHMM 2.0軟件分析該菌株基因組中Sec途徑的底物蛋白，同時采用COG功能數據庫進行功能分析。［結果］通過分析發現亞硝化單胞菌is79a3菌株編碼Sec途徑分泌裝置有關的蛋白15個，包含Sec途徑分泌系統中12個轉運蛋白編碼基因，1個信號肽識別蛋白編碼基因和2個信號肽酶蛋白編碼基因；Sec途徑底物蛋白分析結果顯示366個含有Sec途徑Spase I類肽酶識別的信號肽，36個蛋白只含有Spase II類肽酶識別的信號肽。402個Sec途徑底物蛋白功能分析結果顯示：有272個蛋白功能不清楚，130個蛋白有具體的功能注釋。［結論］亞硝化單胞菌is79a3 Sec途徑分泌裝置完整，該菌株Sec途徑底物蛋白大多數沒有功能注釋和功能未知，在有功能注釋的蛋白中，主要參與細胞壁/細胞膜的生物合成、蛋白質翻譯后修飾/蛋白更替、無機離子轉運代謝、能源產生與轉換。 |
| 附 件 |
亞硝化單胞菌is79a3Sec途徑分泌系統及底物蛋白分析
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