作 者 |
王鵬飛,高歡歡,蘇玲,蔣錫龍,吳新穎,楊立英,任鳳山,王詠梅 |
第一作者 |
王鵬飛 |
作者單位 |
山東省葡萄研究院,山東濟南 |
卷 號 |
46 |
發表年份 |
2018 |
發表刊期 |
1 |
發表頁面 |
96-101 |
關 鍵 字 |
果蠅;葡萄;線粒體;密碼子偏好性;NADH dehydrogenase subunit;RSCU, |
摘 要 |
[目的]分析2種果蠅(Drosophila melanogaster與D.sechellia)線粒體基因組及NADH dehydrogenase subunit基因的密碼子偏好性。[方法]利用CodonW1.4計算密碼子偏好性參數的相關參數。[結果]2種果蠅線粒體中蛋白編碼基因的AT含量比GC含量更高。D.sechellia 的線粒體基因組的密碼子偏好性比黑腹果蠅D.melanogastera的線粒體基因組的密碼子偏好性略強。2種果蠅線粒體基因組中各蛋白編碼基因CDs中,RSCU值大于1的密碼子都是以A或U結尾,而并不以C或G結尾。2種果蠅線粒體基因組及NADH dehydrogenase subunit基因簇基因的密碼子偏好性都可能受到突變壓力影響。D.melanogaster 線粒體基因組中不存在密碼子CGC。NADH dehydrogenase subunit 3基因的密碼子偏好性可能比其他NADH dehydrogenase subunit基因更高。此外,盡管大部分NADH dehydrogenase subunit基因偏愛使用A或U結尾的密碼子,但是在NADH dehydrogenase subunit 6基因中,有2個AU結尾的密碼子(AGA、GCA)的RSCU也為0。[結論]該研究結果為2種果蠅線粒體的進化研究提供了新觀點。 |
附 件 |
2種果蠅(Drosophila melanogaster與D.sechellia)線粒體及NADH dehydrogenase subunit基因的密碼子偏好性分析
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