2018年08期

野生秦嶺羚牛瘤胃產甲烷古菌多樣性研究

作  者 蘭阿峰,楊曼,郭素芬,鄧百萬
第一作者 蘭阿峰
作者單位 陜西理工學院生物科學與工程學院,陜西漢中
卷  號 46
發表年份 2018
發表刊期 8
發表頁面 88-91
關  鍵  字 野生秦嶺羚牛;瘤胃;產甲烷古菌;分子多樣性,
摘  要 [目的]了解野生秦嶺羚牛瘤胃產甲烷古菌的組成及其多樣性。[方法]提取野生秦嶺羚牛瘤胃內容物總DNA,選用產甲烷菌特異性引物 Met86F和Met1340R,對總DNA進行16S rRNA特異性擴增,構建秦嶺羚牛瘤胃產甲烷古菌16S rRNA克隆文庫,對陽性克隆進行PCR-RFLP(限制性內切酶片段長度多態性)分析,并對Hae Ⅲ 酶切帶譜不同的菌液進行測序,構建系統發育樹。[結果]根據酶切帶譜分析和測序結果的不同,將隨機挑取的105個陽性克隆歸為14個不同的可操作分類單元(OTUs)。系統發育分析表明,這些克隆序列均位于廣域古菌門(Euryarchaeota),隸屬甲烷桿菌科(Methanobacteriaceae,65.71%)、Methanomassiliicoccus(29.52%)和Methanosarcinaceae(4.76%)3個科。其中有57個序列與可培養菌相似度在97%以上,分屬于Methanobrevibacter millerae、Methanobrevibacter olleyae 和Methanobrevibacter thaueri。其余48個序列與未培養菌相似度較高,占11個OTUs。[結論]野生秦嶺羚牛瘤胃產甲烷古菌多樣性比較豐富,且可能存在新的分類單元。
附  件 野生秦嶺羚牛瘤胃產甲烷古菌多樣性研究
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