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2018年11期
生物土壤結皮土生對齒蘚轉錄組SSR位點分析
| 作 者 | 陳莉,趙浩然,黃琳淞,玉蘇甫江 |
| 第一作者 | 陳莉 |
| 作者單位 | 西北民族大學生命科學與工程學院，甘肅蘭州 |
| 卷 號 | 46 |
| 發表年份 | 2018 |
| 發表刊期 | 11 |
| 發表頁面 | 78-80 |
| 關 鍵 字 | 土生對齒蘚；轉錄組；SSR, |
| 摘 要 | ［目的］分析生物土壤結皮土生對齒蘚轉錄組SSR位點。［方法］以生物土壤結皮土生對齒蘚為材料，分析土生對齒蘚轉錄組數據，開發土生對齒蘚SSR分子標記技術。［結果］通過MISA軟件對土生對齒蘚高通量測序獲得的73 084條unigenes進行SSR篩選。從搜索序列中發現4 103個符合條件的SSRs，分布在3 420條unigenes上，出現頻率為5.62%。三核苷酸和二核苷酸為主要重復類型，分別占SSR總數的47.9%和26.1%,AGC/CTG（31.9%）和AG/CT（75.5%）分別是其主要重復基元。69.0%的基序長度為12~20 bp。［結論］土生對齒蘚轉錄組SSR位點出現頻率高、類型豐富、多態性潛能大，為土生對齒蘚分子生物學機制研究等方面提供理論依據。 |
| 附 件 |
生物土壤結皮土生對齒蘚轉錄組SSR位點分析
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