2018年22期

沙田柚生長素響應基因SAUR的鑒定及序列分析

作  者 陳玉梅,李璐璐,徐 媛,陳錦玲,李惠敏,秦新民
第一作者 陳玉梅
作者單位 廣西師范大學生命科學學院,廣西桂林
卷  號 46
發表年份 2018
發表刊期 22
發表頁面 81-84
關  鍵  字 沙田柚;自交不親和;SAUR基因;序列分析,, 沙田柚;自交不親和;SAUR基因;序列分析,
摘  要 [目的]研究沙田柚生長素響應基因SAUR基因編碼的蛋白質序列所包含的生物信息學。[方法]以沙田柚自交和異交花柱為材料,通過高通量測序技術進行轉錄組測序,在差異表達基因中鑒定出SAUR基因。[結果]該基因全長857 bp(登錄號為MH281940),開放閱讀框(ORF)為381 bp,編碼126個氨基酸,編碼的蛋白質理論等電點為5.76,相對分子質量為13.74 kD,含有1個與Auxin_inducible superfamily蛋白相同的保守結構域。沙田柚SAUR基因在自交1~3 d花柱中的表達量(RPKM)分別為8.42、56.02、53.45;而在異交1~3 d花柱中的表達量分別為11.98、36.74、8.53。氨基酸序列分析表明,該基因編碼的氨基酸與克萊門柚和甜橙SAUR基因編碼的氨基酸的同源性分別為100%、99%。系統進化樹顯示,沙田柚SAUR基因與克萊門柚和甜橙的親緣關系很近,屬同一進化分支。[結論]研究結果可為今后深入研究沙田柚自交不親和機理提供參考。
附  件 沙田柚生長素響應基因SAUR的鑒定及序列分析
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