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2018年24期
基于家蠶中腸RNA-seq數據的新基因發掘及初步分析
| 作 者 | 周凱月, 唐健, 李玉霞, 郝長富, 徐安英 |
| 第一作者 | 周凱月 |
| 作者單位 | 江蘇科技大學生物技術學院，江蘇鎮江 |
| 卷 號 | 46 |
| 發表年份 | 2018 |
| 發表刊期 | 24 |
| 發表頁面 | 60-64 |
| 關 鍵 字 | 轉錄組測序；新基因；序列比對；功能分析, |
| 摘 要 | 對前期獲得的家蠶中腸組織轉錄組數據進行進一步生物信息學分析，利用Cufflinks軟件對Mapped Reads進行組裝，并與參考基因組注釋信息進行比對，共發掘新基因788個。利用Blast軟件將發掘的新基因與NR，Swiss-Prot數據庫比對，其中746個新基因得到功能注釋。這些新發掘基因在家蠶28個連鎖群上都有分布，其中在第15連鎖群上最多。有198個新基因注釋到KEGG數據庫中，分布于85條已知的通路中，將新基因與COG數據進行比對，并進行功能注釋與分類，總共有258個新基因得到了注釋，被分為22個COG類別，部分新基因的克隆分析，與預期結果一致，這些發現為以后進一步研究新基因的功能提供了基礎信息。 |
| 附 件 |
基于家蠶中腸RNA-seq數據的新基因發掘及初步分析
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