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2021年03期
煙草自然抗性相關巨噬細胞蛋白基因家族的鑒定與分析
| 作 者 | 陳邦蘭，翟夢倩，龍濤，趙順程，劉娟，尹茂靈，萬心言，王治杰，劉繼愷 |
| 第一作者 | 陳邦蘭 |
| 作者單位 | 西南科技大學生命科學與工程學院，四川綿陽 |
| 卷 號 | 49 |
| 發表年份 | 2021 |
| 發表刊期 | 3 |
| 發表頁面 | 100-104，109 |
| 關 鍵 字 | 自然抗性相關巨噬細胞蛋白；煙草；基因家族；表達分析 |
| 摘 要 | 自然抗性相關巨噬細胞蛋白（natural resistance associated macrophage proteins，NRAMPs）是一類高度保守的二價金屬跨膜轉運蛋白，在調控生物體內重金屬穩態中發揮著重要作用。為了探究煙草NRAMP基因的多樣性，該研究根據煙草基因組數據信息，利用生物信息學方法對煙草NRAMP基因家族成員進行了鑒定，對其基本信息、結構特點、蛋白理化性質及保守序列、啟動子元件和組織表達模式等進行了分析。結果表明：煙草基因組含有9個NtNRAMP基因，分別命名為NtNRAMP1.1～6.2，其編碼氨基酸長度為500~542 aa，蛋白分子量為54.31~59.11 kD，等電點為5.09~8.73，總平均親水性為0.475~0.604；除了NRAMP6.1和6.2不含有motif4外，其余NRAMP蛋白都含有motif1~motif10。順式作用元件分析表明所有NtNRAMP基因啟動子中均含有參與基因轉錄、非生物脅迫、植物激素響應和光應答途徑的元件，部分基因含有生物脅迫、次生代謝、組織表達和結合位點的元件。染色體定位發現，6個NtNRAMP基因分別分布在5條煙草染色體上。表達分析表明：NtNRAMP基因組織表達模式差異較大，其中NtNRAMP6.1和NtNRAMP6.2基因表達具有組織特異性。該研究結果為進一步研究煙草NtNRAMP基因的功能奠定了基礎。 |
| 附 件 |
煙草自然抗性相關巨噬細胞蛋白基因家族的鑒定與分析
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