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2013年22期
腦心肌炎病毒多聚蛋白編碼區起始與終止區的密碼子使用模式
| 作 者 | 張瑜，張峰，王樹瑜，孫曉林 |
| 第一作者 | 張瑜 |
| 作者單位 | 甘肅農業大學動物醫學院，甘肅蘭州 |
| 卷 號 | 41 |
| 發表年份 | 2013 |
| 發表刊期 | 22 |
| 發表頁面 | 9202-9204 |
| 關 鍵 字 | 腦心肌炎病毒；翻譯起始區；翻譯終致區；密碼子使用模式 |
| 摘 要 |
文中利用特定區域密碼子使用偏嗜性對數公式分析了腦心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus, EMCV)多聚蛋白編碼基因的翻譯起始區域與翻譯終止區域的密碼子使用模式。結果表明，EMCV多聚蛋白編碼區內翻譯起始序列區的同義密碼子使用偏嗜性的正負偏差總體是平衡的，但幾種在整體多聚蛋白質編碼區域內使用為負偏嗜的稀有密碼子卻傾向于出現于編碼起始區和終止區。這一有趣的現象，可利用“稀有密碼子調控假說”來解釋為EMCV開放閱讀框兩端的稀有密碼子偏好性使用對整體閱讀框的表達具有負調控作用。該研究說明“稀有密碼子調控假說”不僅適用于細菌，而且也適用于一些RNA病毒基因組。 |
| 附 件 |
腦心肌炎病毒多聚蛋白編碼區起始與終止區的密碼子使用模式
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