作 者 | 田玉富,崔璨,謝龍飛,李桂英,楊成君 |
第一作者 | 田玉富 |
作者單位 | 東北林業大學林學院,黑龍江哈爾濱 |
卷 號 | 42 |
發表年份 | 2014 |
發表刊期 | 23 |
發表頁面 | 7703-7709 |
關 鍵 字 | 吉爾吉斯白樺;WRKY轉錄因子;生物信息學分析 |
摘 要 |
從吉爾吉斯白樺轉錄組文庫測序中獲得白樺BkWRKY1轉錄因子的cDNA序列,該序列包含2 189個堿基。序列比對和同源性分析表明,該基因cDNA序列包含1 728 bp的開放閱讀框,可編碼575個氨基酸,5′非翻譯區(UTR)為119 bp,3′非翻譯區(UTR)為342 bp。該基因屬于WRKY transcription factor家族,含有2個WRKY結構域,蛋白分子量為62.483 kD,理論等電點為7.32,負電荷殘基(Asp+Glu)總數為62個,正電荷殘基(Arg+Lys)總數為62個。蛋白不含有信號肽,具有一定的親水性,為親水蛋白,無跨膜結構。同源性比較與進化樹分析表明,吉爾吉斯白樺WRKY蛋白與大豆和蒺藜苜蓿的WRKY蛋白在進化上關系較近。該基因在0.6%NaHCO3脅迫處理后表達量增加,為上調表達基因。 |
附 件 | 吉爾吉斯白樺BkWRKY1基因克隆與序列分析 |
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