亞東鮭線粒體COⅠ與 COⅡ基因遺傳多樣性分析

作  者 李福貴,鄒曙明
第一作者 李福貴
作者單位 上海海洋大學水產與生命學院農業部淡水水產種質資源重點實驗室,上海
卷  號 42
發表年份 2014
發表刊期 23
發表頁面 7710-7713
關  鍵  字 亞東鮭;COⅠ基因;COⅡ基因;序列特征;遺傳機制;遺傳分化
摘  要

 [目的] 分析亞東鮭線粒體COⅠ與 COⅡ基因遺傳多樣性。[方法] 分別從西藏亞東河與亞東鮭養殖站采集野生與養殖亞東鮭各15尾樣品,對其線粒體DNA COⅠ、COⅡ基因全序列進行PCR擴增、測序比對。[結果]序列長度分別為631、634 bp。序列分析結果顯示:30條亞東鮭線粒體DNA COⅠ 、COⅡ序列分別檢測到1種、3種單倍型,均無堿基插入、缺失,COⅡ序列有2個位點出現堿基替換;COⅠ 、COⅡ序列T、C、A和G堿基平均含量分別為29.5%、28.97%,30.6%、28.47%,22.5%、27.03%和17.4%、15.53%,其中A+T的含量(52.0%、56.0%)均顯著高于G+C含量(48.0%、44.0%),均表現出明顯的堿基偏倚;COⅠ 、COⅡ單倍型多態性(h)與核苷酸多態性(π) 值分別為0、0.80與0、0.000 1;根據Kimura雙參數模型構建基于線粒體COⅠ、COⅡ序列的系統進化樹,兩亞東鮭魚遺傳距離分別為0、0.002 4。[結論]西藏亞東鮭的遺傳多樣性水平較低,且養殖和野生群體無遺傳分化。

附  件 亞東鮭線粒體COⅠ與 COⅡ基因遺傳多樣性分析
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