2017年30期

枯草芽孢桿菌subtilis str.168雙精氨酸途徑分泌蛋白預測及功能分析

作  者 韓誠武,尹紅,張路路,白雪,姚嘉,邢雷,張躍華,盧偉,欒積毅,劉向東
第一作者 韓誠武
作者單位 佳木斯大學理學院,黑龍江佳木斯
卷  號 45
發表年份 2017
發表刊期 30
發表頁面 128-130,163
關  鍵  字 枯草芽孢桿菌;分泌蛋白;雙精氨酸分泌途徑;功能分析,
摘  要 [目的]對枯草芽孢桿菌subtilis str.168雙精氨酸轉運途徑(Tat)分泌蛋白進行預測和功能分析。[方法]從NCBI中選取枯草芽孢桿菌subtilis str.168基因組注釋的蛋白質氨基酸序列,然后用SignalP 4.0、LipoP、TatP、TMHMM 2.0軟件分析該基因組中雙精氨酸途徑的分泌蛋白,同時采用COG功能數據庫對預測的分泌蛋白進行功能注釋和聚類分析。[結果]通過分析發現108個有motif沒有酶切位點的Tat信號肽蛋白、25個有酶切位點沒有motif的Tat信號肽蛋白、124個既有酶切位點也有motif的Tat信號肽蛋白,其中105個蛋白歸為Tat途徑的分泌蛋白。[結論]對枯草芽孢桿菌Tat途徑分泌蛋白的基因組預測和功能分析,將為分析該菌胞外蛋白的分泌機制打下基礎。
附  件 枯草芽孢桿菌subtilis str.168雙精氨酸途徑分泌蛋白預測及功能分析
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