作 者 |
王鵬飛,蘇玲,蔣錫龍,楊立英,宮磊,任鳳山,王詠梅 |
第一作者 |
王鵬飛 |
作者單位 |
山東省葡萄研究院,山東濟南 |
卷 號 |
45 |
發表年份 |
2017 |
發表刊期 |
32 |
發表頁面 |
144-151,227 |
關 鍵 字 |
熱休克轉錄因子;葡萄;非生物脅迫;選擇壓力;密碼子偏好性, |
摘 要 |
[目的]從全基因組范圍鑒定葡萄熱休克轉錄因子基因家族,并對其基因結構、蛋白結構、基因啟動子、基因在進化中受到的選擇壓力以及其編碼基因在非生物脅迫下的表達變化進行綜合分析,并對葡萄熱休克轉錄因子基因家族的密碼子使用偏好性進行研究,分析影響葡萄熱休克轉錄因子基因家族密碼子使用偏好性的因素。[方法]利用葡萄基因組數據庫相關數據建庫結合本地BLAST法鑒定序列,利用多重序列比對,進化樹構建等生物信息學方法進行分析。[結果]鑒定了20個葡萄熱休克轉錄因子,并將其分為4個亞組。其中9個熱休克轉錄因子基因在冷脅迫1 h下表達上調,2個在冷脅迫4 h下表達上調。在高溫脅迫14 d條件下,7個熱休克轉錄因子基因表達量下調。在高溫脅迫42 d條件下,8個熱休克轉錄因子基因表達量下調。此外發現,葡萄熱休克轉錄因子家族各成員基因存在密碼子使用偏好性。[結論]該研究為深入研究葡萄熱休克轉錄因子的功能提供了有用的信息。 |
附 件 |
全基因組范圍葡萄熱休克轉錄因子的鑒定與分析
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