2018年16期

玉米β-甘露聚糖酶基因家族的生物信息學分析

作  者 高清松,孫輝,陳國沖,韋雨亭,黃雨晴,史勝男,胥明,周建
第一作者 高清松
作者單位 淮陰師范學院生命科學學院,江蘇淮安
卷  號 46
發表年份 2018
發表刊期 16
發表頁面 93-96,128
關  鍵  字 玉米;甘露聚糖酶;基因家族;進化分析;表達分析, ,
摘  要 [目的]鑒定出玉米基因組中的β-甘露聚糖酶基因(MAN),并分析其進化機制和表達模式。[方法]利用擬南芥MAN蛋白序列在玉米基因組數據庫以及NCBI非冗余蛋白質數據庫中比對搜索,獲取玉米MAN家族全部成員;通過檢索植物基因組復制數據庫查找玉米MAN基因的片段復制事件;利用GSDS 2.0服務器分析基因外顯子/內含子結構;采用MEGA7軟件極大似然法構建系統發育樹;利用芯片數據分析基因在不同組織器官中的表達模式。[結果]玉米基因組中含有6個MAN基因,分布于5條染色體上。沒有玉米MAN基因起源于片段復制或串聯重復事件。系統發育分析將植物MAN蛋白分為3個亞族(I~Ⅲ),說明其序列已發生分化。玉米MAN基因結構較為保守,蛋白質均含有甘露聚糖酶的核心基序。玉米MAN基因具有不同的表達模式,部分基因在發育葉片中表達量較高,部分基因在減數分裂期雄穗中表達量較高,而其余基因在胚芽鞘、初生根、授粉前果穗、花絲和發育種子中表達量較高。[結論]該研究結果為
進一步研究玉米MAN基因功能奠定了基礎。
附  件 玉米β-甘露聚糖酶基因家族的生物信息學分析
注:若需下載,請右鍵單擊另存
點擊關閉

在線客服

服務熱線:0551-65160973

二維碼

m www