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2018年16期
沙田柚類蛋白激酶基因的鑒定及生物信息學分析
| 作 者 | 陳錦玲，徐媛，陳玉梅，李璐璐，李惠敏，秦新民 |
| 第一作者 | 陳錦玲 |
| 作者單位 | 廣西師范大學生命科學學院，廣西桂林 |
| 卷 號 | 46 |
| 發表年份 | 2018 |
| 發表刊期 | 16 |
| 發表頁面 | 88-92 |
| 關 鍵 字 | 沙田柚；類蛋白激酶基因；生物信息學分析, |
| 摘 要 | ［目的］ 研究沙田柚類蛋白激酶基因編碼的蛋白質序列所包含的生物信息學。［方法］ 利用高通量測序對沙田柚自交和異交花柱進行轉錄組測序，通過差異分析得到沙田柚類蛋白激酶基因序列。采用生物信息學方法，對其編碼的蛋白質從序列特征、理化性質、跨膜結構域、高級結構以及功能域等方面進行預測和分析。［結果］ 該基因全長為2 323 bp，開放閱讀框（ORF）全長為1 560 bp(Genbank登錄號：MG925820)，共編碼519個氨基酸，分子質量為57.39 kD，等電點PI為8.55。該蛋白質含有1個植物STKc IRAK蛋白家族的保守結構域，為親水性穩定蛋白。氨基酸序列分析表明，其編碼的氨基酸與克萊門柚和甜橙的同源性分別為 100％、99％。系統進化樹表明沙田柚類蛋白激酶基因與克萊門柚和甜橙親緣關系很近，屬于同一進化分支。［結論］ 該研究結果可為今后深入研究沙田柚自交不親和機理提供參考。 |
| 附 件 |
沙田柚類蛋白激酶基因的鑒定及生物信息學分析
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